Nama lembaga ini adalah Institut Studi Islam Darussalam, disingkat ISID, berkedudukan di Pondok Modern Gontor Ponorogo. Institut Studi Islam Darussalam adalah nama baru dari Perguruan Tinggi Darussalam yang didirikan pada tanggal 1 Rajab 1383 / 17 November 1963.

Penyelenggara Institut Studi Islam Darussalam (ISID) adalah Yayasan Perguruan Tinggi Darussalam (YPTD) yang berbadan hukum, didirikan pada tanggal 9 November 1963, berkedudukan di Ponorogo. Adapun badan pembina YPTD sekarang adalah sebagai berikut:

1. Prof. Dr. H. Hidayat Nur Wahid
2. Muhammad Sholihin
3. H. M. Masruh Ahmad, M.A. MBA
4. KH. Sutaji Tajuddin, M.A.

Sedangkan badan pengawas YPTD adalah Dr. KH. Abdullah Syukri Zarkasyi, M.A. KH. Hasan Abdullah Sahal dan KH. Syamsul Hadi Abdan, S.Ag. Dan susunan pengurus YPTD sekarang adalah sebagai  berikut  :

Ketua                    :

• Prof.Dr. H. Dien Syamsuddin.
• Drs. Rusydi Bey Fanani,

Sekretaris           :

• H. Syamsul Hadi Untung, M.A. MLS
• H. Abdullah Baharmus, Lc

Bendahara           :

• Ir. Mohamad Ridho, M.M.
• Hamid Husein, Lc

Adapun Fungsionaris Institut Studi Islam Darussalam (ISID) Pondok Modern Darussalam Gontor Ponorogo adalah sebagai berikut :

Pimpinan Institut

1. Rektor                                     : Drs. H. Kafrawi Ridwan, M.A.
2. Pembantu Rektor I           : KH. Imam Subakir Ahmad
3. Pembantu Rektor II         : H. Mulyono Jamal, M.A.
4. Pembantu Rektor III       : Dr. H. Hamid Fahmy Zarkasyi, M.A. M.Phil
5. Pembantu Rektor IV        : Dr. H. Amal Fathullah Zarkasyi, M.A.

Pimpinan Fakultas

1. Fakultas Tarbiyah

1. Dekan                                  : Drs. H.M. Akrim Mariyat, Dipl.Ad.Ed
2. Pembantu Dekan I             : KH. Heru Saiful Anwar, M.A
3. Pembantu Dekan II           : H. Noor Syahid, S.Ag
4. Pembantu Dekan III         : H. Imam Bahroni, M.A, MLS
5. Ketua Jurusan PAI            : H. Agus Budiman, M.Pd
6. Ketua Jurusan PBA           : H. Abdul Hafidz, M.A.

2. Fakultas Ushuluddin

1. Dekan                                 : Drs. Rif’at Husnul Ma’afi, M.Ag
2. Pembantu Dekan I            : H. Syamsul Hadi Untung, M.A, MLS
3. Pembantu Dekan II          : H. M. Badrun Syahir, M.A.
4. Pembantu Dekan III        : H. Abdullah Rafi’I, S.Ag
5. Ketua Jurusan PA              : H. Adib Fuadi, M.Phil
6. Ketua Jurusan API            : Dr. H. Khalid Muslih, M.A

3. Fakultas Syari’ah

1. Dekan                                 : H. Setiawan Lahuri, M.A.
2. Pembantu Dekan I             : H. Imam Kamaluddin, Lc, M.Hum
3. Pembantu Dekan II           : H. Wahyudi Bakri, M.A, LLM
4. Pembantu Dekan III         : M. Ekhwanuddin Hariarso, S.H.
5. Ketua Jurusan PMH          : H. Imam Awwaluddin, M.A.
6. Ketua Jurusan MLKI         : H. Imam Kamaluddin, Lc, M.Hum

BIRO DAN LEMBAGA

1. Kepala Biro Administrasi Umum                                     : -
2. Kepala Biro Adm.Akademik dan Kemahasiswaan    : Drs. Sujiat  Zubaidi, M.Ag.
3. Kepala Biro Administrasi Non Akademik                    : H. M. Badrun Syahir, M.A.
4. Kepala Perpustakaan                                                            : Dr. H. Dihyatun Masqon, M.A.
5. Kepala Biro Penelitian & Kajian Ilmiah                        : Drs. H. Nasrullah Zainul Muttaqin
6. Kepala Biro Pengabdian Masyarakat                            : Drs. H.Y. Suyoto Arief, MSI
7. Kepala Lembaga Bahasa                                                     : Dr. H. Dihyatun Masqan, M.A.